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4D定量蛋?質組學是在傳統3D蛋?質組學的三個維度,即保留時間(retention time)、質荷?(m/z)和離?強度(intensity)的分離 基礎上,增加了第四個維度(Collision cross-section,肽段的碰撞截?積)盓 即離?淌度(ion mobility)的分離。根據肽段離?在飄移 管中與緩沖?體碰撞時的碰撞截?不同,可將離?按??形狀進?分離,從?降低樣本復雜度,進??幅度的提?掃描速度和檢測靈敏 度,帶來蛋?質組學在鑒定深度、檢測周期、定量準確性等性能上的?命性提升。其在蛋?質組學領域的強?功能和?泛應?前景,具有劃 時代的重?意義。
4D-labelfree蛋?質組學是基于4D tims TOF離?淌度平臺的?標記定量蛋?組學技術,通過數據依賴性采集-同步累積連續碎裂 (ddaPASEF)掃描模式進?差異定量蛋?質組學分析。該技術是對傳統Labelfree蛋?質組學的升級,實現蛋?質組學在覆蓋深度、靈敏 度、通量??的全?性提升。
技術優勢
1.基于timsTOF HT檢測平臺,更適?于微量樣本
2.四維分離,蛋?鑒定度更?
3.PASEF獨特的數據采集模式,實現超?掃描速度
4.相對傳統Label free技術,鑒定深度更?
應用領域
1.疾病?物標志物與藥物作?靶點?通量分析
2.藥物應答、基因敲除/過表達的蛋?表達譜分析
3.植物、微?物??發育與脅迫逆境?理研究
4.蛋?作?機制與特殊功能蛋?質篩選
5.適合臨床微量樣本檢測,如:外泌體、FFPE?蠟切?、活檢穿刺組織等
復合體I(CI)作為最大的呼吸鏈復合體,由14個核心亞基和31個非核心亞基組成。復合體I可以分為嵌入線粒體內膜的膜臂(又可分為PP-a、PP-b、PD-a、PD-b模塊)以及伸入線粒體基質的基質臂(又可分為N模塊和Q模塊)。
結果速遞 TIMMDC1的缺失導致呼吸體亞組裝體的積累 圖1:TIMMDC1的丟失導致呼吸體亞組裝體的積累
RS包含復合體I的PP-b模塊和PD-a模塊 為了進一步闡明來自TIMMDC1缺失細胞的RS中CI成分的作用,基于線粒體CI的最新蛋白質組學分析結果,用代表不同CI模塊的抗體免疫標記RS。利用非變性膠Blue Native PAGE技術和免疫印跡技術研究發現該復合體包含復合體I的PP-b模塊,PD-a模塊,且只有部分CI模塊被組裝到RS上,其中PD-a模塊是RS的關鍵結構組成。 圖2:RS包含復合體I的PP-b模塊和PD-a模塊
RS是TIMMDC1介導的呼吸體組裝的包含CIII和CIV的中間體 T
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