白塞?。?/span>BD）是一種多系統慢性血管炎，具有高度異質性，有多器官受累，包括口腔潰瘍、生殖器潰瘍、葡萄膜炎和皮膚病變，可因動脈瘤破裂或嚴重的神經并發癥而致命。與不同器官相關的BD的分子特征尚不清楚。臨床診斷和后續治療主要取決于臨床癥狀。目前還沒有可用于分化不同器官分辨BD的生物標志物。

2022年9月19日，中國醫學科學院北京協和醫學院李永哲、鄭文潔及國蛋白質科學研究中心于曉波共同通訊在Arthritis & Rheumatology （IF=15.483）在線發表題為“Proteomics Landscape Mapping of Organ-Resolved Beh?et’s Disease Using In-Depth Plasma Proteomics for Identifying Hyaluronic Binding Protein 2 Expression Associated With Vascular Involvement”的研究論文，本研究旨在通過深入的蛋白質組學方法闡明BD的發病機制和異質性，利用深入的蛋白質組學方法確定臨床評估和治療BD患者的生物標志物。

研究思路

研究人員選擇98例BD患者和31名健康對照者血漿樣本，使用深度蛋白質組平臺集成數據獨立采集質譜（DIA-MS）和可定制抗體微陣列對BD進行了全面的血漿蛋白質組分析，并進一步在108例BD患者和29名健康對照者血漿樣本中進行酶聯免疫吸附試驗（ELISA）驗證。

研究結果

與BD相關的差異表達血漿蛋白分析

該研究中，研究人員通過DIA-MS和可定制抗體微陣列，首次對BD進行了全面的血漿蛋白質組分析。一共鑒定了759種蛋白，其中有220個差異表達的蛋白，其中鑒定了215個與BD相關的新蛋白，包括SERPINA3、GPLD1和ATRN（圖2C）。對差異蛋白進行聚類分析，發現可區分88.6%的患者和95.5%的健康對照組（圖2D）。生物信息學分析揭示了與BD發病相關的不同生物學過程，包括補體激活、傷口愈合、血管生成、白細胞介導免疫等。

圖2：DIA-MS和抗體芯片鑒定的BD患者和健康對照組之間差異蛋白分析

為了研究治療對血漿蛋白的影響，研究人員根據糖皮質激素（GCs）和免疫抑制劑的治療對BD患者進行了分組，分析表明接受GCs和免疫抑制劑治療的BD患者與未接受GCs和免疫抑制劑治療的BD患者相比，大多數生物過程的改變與免疫反應的調節有關。

為了進一步研究BD患者之間的異質性，研究人員通過對差異蛋白進行了無監督一致性聚類以及主成分分析顯示I亞型和II亞型與III亞型有明顯的分離。其中I亞型特異性蛋白主要參與凝血和補體激活；II亞型特異性蛋白主要參與葡萄糖、蛋白-脂代謝；III亞型特異性蛋白主要參與炎癥應答。主成分分析的結果發現I亞型和II亞型相似（圖3B），且BD患者I亞型和II亞型具有較高的嚴重程度。

圖3：利用血漿蛋白質組學和臨床變量對BD患者進行分型

研究人員還構建了器官分解BD蛋白質圖譜并確定了與不同器官和蛋白質靶點相關的BD蛋白質組學特征，鑒定出58種不同器官表型的BD 患者中特異性表達的蛋白質，其中有26個在DrugBank database檢索到，可用于臨床或藥物開發，為不同器官相關BD的蛋白質組學特征和蛋白靶點的開發提供了治療的依據。

圖4：血漿蛋白質組學對器官分解的BD進行蛋白定位